Problema motor

Boa tarde
Estou com um pequeno problema no motor do meu vw 1300
Acontece que recentemente o casquilho da vela que colocaram na cabeça do motor saiu, o motor ficou a trabalhar por meros instantes em apenas 3 cilindros.
Entretanto consegui arranjar um nova cabeça com o mesmo numero, até aqui tudo bem, mandei rectificar a cabeça, coloquei-a no motor.
Quando coloquei o motor a trabalhar o motor fez um ruído estranho, parece que é o volante do motor que está a roçar em algum lado, terá a cambota ficado desalinhada por ter ficado a trabalhar em 3 cilindros?